1、反滲透膜水解容易導致反滲透裝置性能惡化。因此，必須嚴格控制水的pH值，供水的pH值在3-11范圍內。
2、次氯酸鈉用量不足，使給水中游離氯無法測定時，反滲透裝置的膜組件上會有黏泥產生，反滲透裝置的壓差增大。但對于聚酰胺膜來講，必須嚴格控制進入膜組件的游離氯量，超過規定值將導致膜的氧化分解。
3、如果將FI值超標的水作為水源供給反滲透裝置，膜組件表面會附著污垢，必須通過清洗去除污垢。
4、給水流量過大會提前降解膜組件，因此給水流量不能超過設計標準值。另外，應盡量避免濃水流量小于設計標準值。如果濃水流量太會使反滲透裝置的壓力容器內發生不均勻的流動及由于過分濃縮而在膜組件上析出污垢。
5、即使反滲透裝置的高壓泵即使有極短的時間中斷運轉，裝置也可能發生故障。
6、反滲透的入口壓力應保持適當的裕度，否則由于沒有適當的壓實，會降低除鹽率。
7、當反滲透裝置停止運行時，反滲透裝置中的水應更換為低壓供水。這是為了防止停運期間二氧化硅的析出。
8、注意保安過濾器的壓差。壓差急劇上升的原因主要是保安過濾器的濁度泄漏。相反，出現壓差急劇下降的原因是精密過濾器元件的破損，以及保安過濾器元件緊固螺絲松動等。
9、當反滲透裝置進出口壓差超標時，說明膜面已被污染或供水流量超過設計值。如果通過流量調節無法解決壓差問題，則應清洗膜面。
10、夏季供水溫度高，產水流量大，有時不得不降低操作壓力，導致水質下降。為了防止這種情況，可以減少膜組件的根數，同時保持較高的操作壓力。
